尋找癌癥的幕后推手

上海雙博生物科技有限公司的研究團隊，開發了分析基因調控和信號網絡的新工具。他們通過這一工具發現，KLHL9基因缺陷是膠質母細胞瘤（一種zui常見的腦癌）背后的重要推手。研究人員在小鼠模型中重新引入KLHL9蛋白，結果成功抑制小鼠體內的腫瘤，為這種致命疾病提供了潛在的新治療策略。

該研究團隊還用同樣的方法，鑒定了與乳腺癌和阿爾茨海默癥有關的可遺傳變異。研究表明，研究人員開發的新算法與細胞調控模型相結合，能夠幫助人們快速鑒定多種疾病的遺傳病因。

在之前的研究中，曾通過計算機模型發現，特定類型的癌癥具有高度保守的“主調控子”，即疾病發展所必需的基因。不過，這些模型并不能體現引起主調控子異常活性的關鍵突變。

在這項新研究中，研究團隊開發了被稱為DIGGIT（Driver-Gene Inference by Genetical-Genomic Information Theory）的新算法，并將其與之前的計算工具結合起來。DIGGIT能夠從主調節子追溯推動癌癥發展的遺傳學事件。DIGGIT的是文章的*作者James C. Chen博士。

研究人員在間充質型的膠質母細胞瘤中測試了上述工具，這是侵襲性zui高的一種膠質母細胞瘤。他們分析了癌癥基因組圖譜計劃（Cancer Genome Atlas）中二百五十多名患者的基因表達和突變譜數據，并由此找到了兩個激活主調控子的基因C/EBPδ和KLHL9。其中，KLHL9之前從未與任何癌癥關聯起來。

隨后，研究人員將膠質母細胞瘤的缺陷型KLHL9基因重新激活，結果使這些細胞喪失了間充質表型。此外，給膠質母細胞瘤小鼠模型引入KLHL9蛋白，也能抑制它們體內的腫瘤。這進一步證明，KLHL9突變是間充質型膠質母細胞瘤的直接動力。

DIGGIT也可以用于分析其它的復雜疾病。利用這種算法，找到了35個對乳腺癌起驅動作用的基因。在之前文獻報道過的25個基因中，DIGGIT鑒定了19個（75%），說明DIGGIT可以用來捕捉不同癌癥背后的驅動性突變。研究人員還用DIGGIT鑒定了推動阿爾茨海默癥發展的14個突變，包括的APOE基因座和已經得到驗證的TYROBP。此外，DIGGIT也識別到了新的突變，包括整合素通路中的四個基因。現在研究人員正在對這些基因進行深入研究。

DIGGIT通過細胞調控網絡追述異?；钚?，進而鑒定致病基因。這種技術能為人們提供致病性分子互作的直接信息，也就是所謂的“機制”。在傳統研究中，這樣的工作需要幾年甚至幾十年才能完成。