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上海博湖生物科技有限公司

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PCR試劑盒反應(yīng)循環(huán)參數(shù)分析

2025-6-9  閱讀(4)

PCR的循環(huán)參數(shù):

1.  預(yù)變性(Initial denaturation)

模板DNA全變性與PCR酶的全激活對(duì)PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時(shí)間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶激活時(shí)間為兩分鐘。

2. 循環(huán)中的變性步驟

循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列全變性,可能的情況下可 縮短該步驟時(shí)間,變性時(shí)間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹di,易造成擴(kuò)增失敗。

3. 引物退火(Primer annealing)

退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴(kuò)增的長度適當(dāng)下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)上做出預(yù)估。退火溫度對(duì)PCR的特異性有較大影響。

4. 引物延伸

引物延伸一般在72℃進(jìn)行(Taq酶最適溫度)。但在擴(kuò)增長度較短且退火溫度較高時(shí),本步驟可省略。延伸時(shí)間隨擴(kuò)增片段長短而定,一般推薦在1000 bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設(shè)定為1 min/kbp。

5. 循環(huán)數(shù)

大多數(shù)PCR含25-40循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴(kuò)增。

6. 最后延伸

在最后一個(gè)循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持5-15分鐘.使引物延伸全,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。





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