化學法是廢水處理的傳統(tǒng)方法，目前以氧化法、電解法以及氧化法等作為制藥廢水的預(yù)處理及2級處理比較常見。研究表明，KMnO4氧化法預(yù)處理中草藥制藥廢水的優(yōu)化反應(yīng)條件為：KMnO4投加量13mg/L，反應(yīng)溫度60℃，反應(yīng)時間25min，pH為6，預(yù)氧化法為后續(xù)處理減輕了很大難度，但是由于反應(yīng)溫度過高，給實際應(yīng)用提出了新的問題。

　微電解法目前已應(yīng)用于工業(yè)廢水的處理。對鐵炭微電解系統(tǒng)處理高氮、難降解制藥廢水進行了研究，結(jié)果表明，填料的粒度，pH、鐵碳含量、氣水體積比和停留時間，影響鐵炭微電解系統(tǒng)的脫氮效率。

化學法也可作為制藥廢水的深度處理方法。研究表明，F(xiàn)enton氧化抗生素廢水2級處理出水的單因素試驗優(yōu)化工藝條件為：H2O2投加量為5mL/L，初始pH為4，F(xiàn)e2+、H2O2摩爾比為1/20，反應(yīng)時間為60min，實驗證明了Fenton氧化作為抗生素廢水3級處理的可行性，但在實際工程中的應(yīng)用還有待考量。