植物根系分析系統從字面上來看，也可以理解它的主要作用是什么，其實植物根系分析系統主要就是用于植物根系的分析，它可以分析測量根總長；根平均直徑；根總面積；根總體積；根尖計數；分叉數；交叉數；根直徑等級可不等間距地自定義分段直徑，自動測量各直徑段長度、投影面積、表面積、體積等，及其分布參數；根尖段長分布；能進行根系的顏色分析，確定出根系存活數量，輸出不同顏色根系的直徑、長度、投影面積、表面積、體積；能進行根系的分析，自動確定根的連接數、關系角等，可單獨自動分析主根或任意一支側根的長度和分叉數等；可單獨顯示標記根系的任意直徑段相應各參數（分檔數、檔直徑范圍任意可改）；能進行根的分叉裁剪、合并、連接等修正，修正操作能回退，以快速獲得99%正確的結果。精度：根長≤±1%；面積：優質圖像質量時<1%，標準圖像質量時≤3%；可兼做針葉面積、體積測量，以及棉纖維粗細、長度測量。
可能會有人好奇，植物根系分析系統都是應用到哪些領域呢，因為在一般的農業生產中，也不需要進行這些方面的測定。但其實隨著科技的發展，在農業的很多領域都開始展開了這些研究工作，而植物根系分析系統就是研究人員的好幫手，從目前的應用來看，植物根系分析系統可應用于園藝、農學、林學、生態、植保、生命科學、煙草、作物、土壤、棉花、茶葉、果樹等領域。
當然，植物根系分析系統應用的最終目的，是通過分析研究，提高農業的生產息率和效率，從而實現農業效益的，因此非常適合以上領域中。
