玉米考種是育種過程中很重要的工作，可以選育出優良品種，實現增產增收。考種是需要測定多項指標的，這在過去想要快速完成玉米考種是非常難的，而現如今，工作人員可以使用玉米考種分析系統實現考種指標自動分析。下面我們就將傳統方式與玉米考種分析系統進行對比。
傳統的考種方式多是由人工測定完成的，具有以下幾個缺點：
1、人員多：由于傳統考種工作都是人工完成的，因為玉米材料眾多，特別是近幾年的玉米單倍體育種技術應用，各家都有上萬個組合需要考種，需要大量科研人員參與考種，有時需要臨時招聘些當地農民工。
2、粗放作業：通常考種工作，將收獲玉米果穗晾曬好，從紗網袋選擇幾個好的沒有蟲害霉變的果穗，用手一掰，看玉米籽粒的整齊度，穗行數等，用眼看玉米穗軸粗細，挑選后人工脫 200 粒左右，裝到紙袋留作南繁用。
3、誤差大：通常考種工作，用一桿尺子，一桿秤去考種，尺子量，用眼瞪，每個人看的都不一樣，加上這幾年臨時聘請的當地農民工60歲，多數已花眼，造成誤差更大，精度更差。
4、考種指標少：傳統考種只能簡單測量穗軸，穗長等簡單指標，穗投影面積、禿尖長、禿尖比例、粒寬、粒厚、粒長、籽粒面積等指標難以測定。
5、效率低：8 個人，8 個環節，一坐 8 個小時，一天只能完成 300 份樣品。
而玉米考種分析系統是通過圖像自動分析出各項數據的，所需的人力少，且準確性較高，可同時成像分析，玉米果穗：10個/次/分鐘、玉米截面：35個/次/2分鐘，并自動測出各玉米穗長、穗粗、禿尖長、左右穗緣角、穗行角、平均行粒數、粒厚、截面穗行數、穗粗、軸粗，顏色以及其平均值，可測出各玉米截面上的粒長、粒寬、顏色（RGB具體數值表示）、粒高等參數，高效完成考種工作。
