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上海滬宇生物科技有限公司

轉錄組測序結合蛋白質組分析探索蠑螈再生奧秘

時間:2013-4-16閱讀:170
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來自德國及美國等處的研究人員針對基因組特別大,難以進行全基因組測序的動物,提出了以轉錄組測序與蛋白質組分析聯合以解析功能基因的策略,并以蠑螈進行實驗,開辟了組織及器官再生研究的新思路。
然而蠑螈的基因組十分龐大,比人類基因組大十倍,要從頭獲得蠑螈的全基因組序列不容易。因此研究者們將目光轉向基因表達所產生的RNA,他們利用454新一代測序技術對蠑螈的轉錄組進行了研究。經過從頭組裝N. viridescens的轉錄組,獲得了超過120,000RNA轉錄本,約有15,000個轉錄本編碼蛋白質,其中有826個轉錄本是蠑螈所*的。這些轉錄本中包含了不同器官所有再生階段的轉錄本,這些轉錄本中的一部分與其它生物相似。通過對蠑螈胚胎和幼體的心臟、四肢、眼睛、尾、肝臟、脾臟等組織中再生過程表達的蛋白的分離以及質譜分析方法,對這些蛋白進行分類及與轉錄本的比對。生物通
通過454新一代測序結果與質譜技術的結合,發現了500多個其它生物中從未被發現的肽段,接下來會進一步探索這些蛋白是否與再生能力相關。這項研究不僅為目前科學家們提供了兩棲類動物的基因數據,更為基因組測序困難的動物研究,提出了一種新思路。
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