研究解開了禽傳染性支氣管炎病毒（IBV）的木瓜樣蛋白酶（PLpro）的晶體結構，發現IBV的PLpro以不同于其他PLpro的催化效率進行去泛素化，從而為開發抗病物提供了一種框架。

冠狀病毒（CoVs）的木瓜樣蛋白酶（PLpro）可進行非結構性蛋白的蛋白水解成熟，在病毒復制過程中發揮作用，并完成宿主細胞因子的去泛素化，以破壞抗病毒反應。禽傳染性支氣管炎病毒（IBV）是在雞支氣管炎的病原體，每年導致家禽業巨大的經濟損失，編碼PLpro。這個PLpro的底物特異性仍不清楚。

在這項研究中，研究人員表明，IBV的PLpro可將Lys48-和Lys63-連接的聚泛素鏈降解成單泛素體，而不是線性的多泛素體。為了解釋底物的特異性，該研究小組解開了IBV的 PLpro的晶體結構（在2.15-?分辨率）。整體結構讓人想起嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒PLpro的結構。然而，不同于嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒PLpro，其缺乏去泛素化酶的封閉回路（BL）1，IBV PLpro具有短的BL1樣環。

對一個保守的催化三分子（由cys101、His264和Asp275組成）的訪問，是由彈性BL2調節。一個泛素結合的IBV冠狀病毒PLpro模型，在PLpros底物結合位點出現關鍵差異。特別是，P3和P4次位點以及與泛素β桶狀結構相互作用的殘基是不同的，從而表明不同的催化效率和底物特異性。該研究表明，IBV PLpro以不同的催化效率裂解肽底物KKAG-7-amino-4-methylcoumarin和LRGG-7-amino-4-methylcoumarin。這些結果表明，IBV PLpro的底物特異性不同于其他PLpros，IBV PLpro可能靶定不同的泛素化宿主因子，來幫助病毒的傳播。