病毒
《Nature》：中國科學家領(lǐng)導(dǎo)的一個研究小組對2014年秋天在塞拉利昂收集的一些埃博拉病毒分離株進行基因組序列分析，追蹤了埃博拉疫情后期階段這一病毒的多樣性和進化。
Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone
《Cell》：哈佛大學、Broad研究所、美國疾控中心（CDC）、美國國家過敏和傳染病研究所（NIAID）等機構(gòu)的研究人員測序了兩百多個埃博拉病毒樣本的基因組，進行了迄今為止zui全面的分析，展示了病毒在這么長時間里發(fā)生的改變。
Ebola Virus Epidemiology, Transmission, and Evolution during Seven Months in Sierra Leone
《Nature》：巴斯德研究所、法國國家科學研究中心和悉尼大學的科學家們通過對病毒株進行基因組測序，鑒別出埃博拉病毒遺傳變異的特征，揭示出有三種不同的病毒變種在幾內(nèi)亞，尤其是首都的城市區(qū)域和附近的市鎮(zhèn)同時傳播。
Distinct lineages of Ebola virus in Guinea during the 2014 West African epidemic
《Nature Genetics》：一個跨國團隊收集并分析了來自99個國家的4987個北京系結(jié)核分枝桿菌樣本，并對其中110個樣本進行了全基因組測序，對其他樣本進行了部分測序。結(jié)果顯示北京系結(jié)核分枝桿菌出現(xiàn)以來，感染力變得越來越強，完勝其他結(jié)核分枝桿菌。
Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage
《mBio》：美國科學家發(fā)現(xiàn)埃博拉病毒基因組變化可能會對基于埃博拉病毒序列而研發(fā)出來的治療方法產(chǎn)生負面影響，因此應(yīng)對現(xiàn)在正在應(yīng)用的治療方法進行重新評估。
Evaluation of the Potential Impact of Ebola Virus Genomic Drift on the Efficacy of Sequence-Based Candidate Therapeutics
《PNAS》：復(fù)旦大學醫(yī)學院的研究人員與來自中國、西班牙、瑞士等國的科學家們采用全基因組測序結(jié)合大規(guī)模基因分型，揭示出了結(jié)核分枝桿菌北京家族菌株的起源、進化及其與現(xiàn)代人類遷移的。
Southern East Asian origin and coexpansion of Mycobacterium tuberculosis Beijing family with Han Chinese
《Genome Announcements》：復(fù)旦大學基礎(chǔ)醫(yī)學院在上*次獲得了完整的腦膜膿毒黃桿菌全基因組序列。該完整參考序列將作為腦膜膿毒黃桿菌的標準全基因組參考序列，有效推進腦膜膿毒黃桿菌基礎(chǔ)和應(yīng)用微生物組學及醫(yī)學的研究。
Complete Genome Sequence of Elizabethkingia meningoseptica, Isolated from a T-Cell Non-Hodgkin's Lymphoma Patient
《PNAS》：墨爾本大學帶領(lǐng)的一個科學家小組從世界各地37個研究機構(gòu)和六個國家獲取300株細菌樣本，解碼了肺炎克雷伯菌（KP）基因組，使科學家們獲得有價值的數(shù)據(jù)，走在KP演化的前面。
Genomic analysis of diversity, population structure, virulence, and antimicrobial resistance in Klebsiella pneumoniae, an urgent threat to public health
《mBio》：哥倫比亞大學的病毒學家發(fā)現(xiàn)了一種新病毒，命名為人hepegivirus 1（HHpgV-1）。從遺傳學序列上看，這種新病毒與嚴重損傷肝臟的丙肝病毒和人類pegivirus（曾被稱為庚型肝炎病毒）有些相似。
Virome Analysis of Transfusion Recipients Reveals a Novel Human Virus That Shares Genomic Features with Hepaciviruses and Pegiviruses
宏基因組
《Cell》：華盛頓大學的研究團隊通過計算分析定位了每個序列的菌種來源，發(fā)現(xiàn)在一百多人的微生物組中，有幾十個菌種的五千多個基因存在著顯著的拷貝數(shù)變化。
Extensive Strain-Level Copy-Number Variation across Human Gut Microbiome Species
《mBio》：多國科學家對zui常用的復(fù)雜微生物群落高通量宏基因組技術(shù)進行評論和總結(jié)，并討論了它們的特點、優(yōu)點及其在環(huán)境科學中的應(yīng)用，主要集中于復(fù)雜微生物系統(tǒng)的分析。
High-Throughput Metagenomic Technologies for Complex Microbial Community Analysis: Open and Closed Formats
《Cell Host & Microbe》：華大基因和瑞典哥德堡大學的研究人員對98名一歲以內(nèi)的瑞典嬰兒的糞便進行宏基因組niao槍法測序，鑒定了四千多個新細菌基因組。發(fā)現(xiàn)即使引入了固體食物，非母乳喂養(yǎng)嬰兒的微生物組仍舊比母乳喂養(yǎng)嬰兒更接近成人。
Dynamics and stabilization of the human gut microbiome during the first year of life
《mBio》：中國研究人員在121份大熊貓糞便樣本中使用了稱為16S rRNA基因測序的實驗室技術(shù)。研究顯示大熊貓表現(xiàn)出極低的腸道菌群多樣性，整體結(jié)構(gòu)不同于非熊貓的食草動物，卻類似于肉食性和雜食性的熊。
The Bamboo-Eating Giant Panda Harbors a Carnivore-Like Gut Microbiota, with Excessive Seasonal Variations
《Nature Medicine》：北京協(xié)和醫(yī)院和華大基因等機構(gòu)的研究人員共同合作完成了類風濕關(guān)節(jié)炎（RA）患者口腔和腸道微生物元基因組研究。
The oral and gut microbiomes are perturbed in rheumatoid arthritis and partly normalized after treatment
《Cell》：一個研究小組建立了世界上zui大的拉沙病毒（Lassa virus，LASV）數(shù)據(jù)集。這一新基因組目錄包含了從塞拉利昂和尼日利亞患者樣本，及主要的動物宿主多乳小鼠野外樣本中采集的近200個病毒基因組。
Clinical Sequencing Uncovers Origins and Evolution of Lassa Virus
《Nature Biotechnology》：深圳華大基因研究院、哥本哈根大學等研究機構(gòu)的科研人員構(gòu)建了世界*較為完整的小鼠腸道微生物基因集，為以小鼠為基礎(chǔ)的人類疾病模型研究提供有益參考。
A catalog of the mouse gut metagenome
《Science》：來自美國50家機構(gòu)的48位科學家組成的一個聯(lián)合小組，倡議開展一項浩大的研究，以理解和利用微生物組——棲息在多種多樣生態(tài)系統(tǒng)（如人類腸道和海洋）的微生物群落，來改善人類健康、農(nóng)業(yè)、生物能源和環(huán)境。
A unified initiative to harness Earth's microbiomes
《Nature》：三位杰出的學者認為，Unified Microbiome Initiative將發(fā)展變革工具和研究小組，并提出一項微生物組倡議，將補充這項美國計劃的工作。
Microbiology: Create a global microbiome effort
《Science Translational Medicine》：加州大學洛杉磯分校（UCLA）的研究人員利用宏轉(zhuǎn)錄組分析，發(fā)現(xiàn)痤瘡患者和健康人的皮膚菌群轉(zhuǎn)錄譜并不相同。
Vitamin B12 modulates the transcriptome of the skin microbiota in acne pathogenesis
《Nature》：德國馬克斯普朗克植物育種研究所和蘇黎世聯(lián)邦理工大學合作，將模式植物擬南芥（Arabidopsis thaliana）葉片和根中發(fā)現(xiàn)的細菌，培育出了超過一半。
Functional overlap of the Arabidopsis leaf and root microbiota
《Nature Biotechnology》：斯坦福大學的研究人員將Illumina長讀取技術(shù)（TruSeq SyntheticLong-Reads）與計算工具結(jié)合起來，獲得了一名男性腸道微生物組的清晰圖譜，揭示了腸道微生物組的驚人多樣性。
Synthetic long-read sequencing reveals intraspecies diversity in the human microbiome